1. 刚买来或采收之种子，因为杂质可能会很多，此等杂质会影响到种子粒数的估算，因此就需要先经过清理。
2. 种子经常保存在干燥低温状态，不常用者置于-20℃冷冻柜，常用者分装后置于5℃冰箱；这些种子需要用胶袋或铝箔带紧密包装，并在包装内、外分别注明:1、购入(采收)日期，2、(品)种名，3、来源，4、发芽率，5、千粒重，6、含水量。
3. 种子包装后置于密封罐之中，再置低温储藏。从冰箱拿出种子后，须将密封罐置室温下若干时间，俟种子回温后才能打开取出包装，否则种子易吸水气。拿到所需要的量后马上再密封装罐放回冰箱，勿放在室温下太久。
土地整平，加水湿润后，先决定穴播或条播，然后挖穴或沟，务使播直。播种深度常为1cm，微小种子常为3-5cm，但以各种植物的推荐深度为准，而且每粒的深度要一致。播完覆土，并略加压使种子与土粒接触。
选择适当的容器与培养土。一般合适的培养土是2份腐植土、2份砂土与1份壤土。培养土适度给水后放入容器内压实。种子平均播于土面，然后用蛭石或粗砂粒拌培养土盖在种子上。细小种子如四季海棠者，种子与细沙相拌后一齐播种，不用另盖土。为防止培养土水分快速丧失，可用透明塑料纸封口。
2. 以卷纸法进行发芽试验。纸卷法是两张吸水纸在下，一张在上，种子平均铺于其中，然后如包春卷法卷起，再放入塑料带内，塑料带封口封上后，直立置于温箱中。纸卷下端需折起，以防种子掉落。纸卷内、外皆需置写卷标，以防混淆。吸水纸在使用前需先吸足水，然后拧干，直到整卷纸不再滴水。
3. 发芽期间可能因水份蒸散而抑制发芽，因此每约三至七天，宜做观查，若水份不足时，宜略喷水，唯仍不可过量，特别如豆类种子等，所吸收水量甚多，需于卷纸后半天或一天后，马上观察是不是要加水。
4. 自卷纸那天起通常七天后观察一次十四天后再观察一次共观察两次。第一次观察时把长芽者算出来并把它挑掉纸包重卷放回胶袋内待下次观察至最后一次观察。每次观察之发芽数须登记下来。应注意各别种子的正/异常苗的正确判断方法。
5. 有些种子在适温下发芽速度较快，故可能不到第七天便要观察(如菠菜西红柿)否则待第七天观察时幼株纠作一团。
播种后种子在一段时间后会发芽，时间的长短不一定，因种类而异。不能发芽者，有三个原因，第一、种子已无生命；第二、种子是活的，但是发芽的环境不合适；第三、种子处在休眠状态，没有一点合适的环境来发芽。休眠，能够说是种子的一种特性，休眠深浅的程度反应于种子发芽的环境需求(包括温度、水分、光照与氧)的宽窄；能发芽的环境范围越宽广，表示该种子的休眠性越弱，反之，范围越窄，休眠性越深；这四个环境的可能范围下种子完全不能发芽的就是处于完全的休眠。活种子能否发芽则由种子本身的休眠程度，以及环境是否在该种子可以发芽的范围以内等两大因素所共同决定。
许多种子刚成熟时具有程度不一的休眠性，但是在干燥的状况下，休眠性会逐渐消失。干燥后熟的速度因植物种类、温度与种子含水率而异。温度越低干燥种子休眠维持的越久。种子含水率在12到14.5%之间时，并不影响温度解除水稻种子休眠的能力，但是在4.9 - 11.8%之间，则越干燥，解除的效果越差。不过在后熟时，时间过久，特别是温度或种子含水率高时，会造成种子活力的丧失，宜特别小心。
许多休眠种子在经过一段湿冷的时间后，休眠性逐渐消失乃至于全部解除。这种湿冷解除休眠的效果常用来做为人为的低温吸润处理，常称为层积处理，因为早期在进行湿冷处理时，常以一层一层的湿砂来埋种子(或需处理的球茎)。湿冷处理有三个要件，即是足够的种子水分含量、低温、以及氧的存在。现在也可以用湿海草与种子相混，包于塑料袋内放在冷藏箱中处理。温度以5-10℃为宜。所需时间因植物种类而有很大的差异，反映出休眠程度的深浅。许多禾谷作物栽培种者仅须两三天即可，蔷薇科种子常需三到四个月之久。
许多种子经湿冷处理解除休眠后，需要移到较高的温度才会发芽，是因为其无休眠种子发芽的适温范围略高所致；若其适温范围包含低温则可以直接在湿冷上发芽。
有些种子在湿冷处理前还需要先行一段高温吸润的处理，才能解除休眠。例如台湾红豆杉种子先以23/11℃变温下行湿温处理六个月后，再以5℃层积三个月，可以解除休眠。
将种壳进行侵蚀、割伤、磨伤、部份甚或全部摘除等手术，使得种壳的限制发芽能力减少或消失。对于硬实种子（泡水后不吸水者），处理种壳的方法很多，包括种壳割痕、强酸侵蚀、热水浸烫等。种子数量少时，可以用刀刻法在种壳上割痕，或在砂纸上磨擦，只要避开胚轴、胚根的部位，在其相对的种壳上划一小处，让水能进入即可。数量多时则以机械磨擦为宜，商业生产时还需使用流动式的磨擦机。强酸侵蚀也是小规模种子所常用的方法。一般都会采用浓硫酸，种子浸于浓酸中约15-30分钟左右，然后取出种子沥尽酸液后倒入大量的流动水中清洗即可；绝对禁止将水倒入泡在酸液的种子上，以免危险。用热水泡硬粒种子，也是常用的软化处理。通常先煮沸一锅水，熄火，然后将整批种子倒入水中，令其自然冷却即可将种子捞出播种。
对于少量的非硬粒种壳休眠种子(可吸水而不发芽者)，用刀割痕或剥除部份种壳是较可行的方法。对于机械性种壳休眠的种子，由于壳厚，要在靠近胚根(发芽孔)部位用刀削薄或以砂纸磨薄，更简单的方法是将种子表壳先略为干燥后，放在平行颚虎钳钳口中，摇动手柄压挤种子，听到剥裂声时立刻松手，可以将厚壳压裂而不会伤到胚部。
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